Detail View - Data AccessID 91
General Information
Experiment Description
Organism | Rattus |
Strain | C57BLKS/J-m+/+db and mutants |
Data type | metabolites at steady-state |
Data units | unitless |
Execution date | not specified |
Experimental Details
Temperature (°C) | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pH | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Carbon source | glucose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Culture mode | batch | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Process condition | aerobic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dilution rate (h⁻¹) | not specified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Working volume (L) | 0.0005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biomass concentration (g/L) | not specified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Medium composition | PBS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General protocol information |
Sampling method:
The mice were sacrificed by decapitation at 17-wk of age, and specimens of hippocampus were collected manually. Quenching procedure: specimens of hippocampus were dissected immediately, snap-frozen in liquid nitrogen and stored at -80 °C until use. Extraction technique: chloroform Sample analyzing method: NMR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Methods description - Notes | The preparation of the brain extracts was based on the previous reference [1]. The frozen tissue was weighed and ground using an electric homogenizer with ice-cold methanol (4 mL/g) and distilled water (0.85 mL/g) at 4°C and the mixture was vortexed. Chloroform (2 mL/g) and
...
distilled water (2 mL/g) was added and mixed again. After keeping on ice for 15 min, the homogenate was centrifuged at 1,000 g for 15 min at 4°C. The supernatant was extracted and lyophilized for about 24h. The metabolite mixture obtained was then weighed and dissolved in 0.6 mL of 99.5% D2O for NMR spectroscopy. One-dimensional ZGPR pulse sequence was used, and the main parameters were set as follows: data points, 64 K; spectral width, 12,000 Hz; relaxation delay, 10 s. The spectral segments for each NMR spectrum were normalized to the total sum of the spectral intensity to partially compensate for differences in concentration of the many metabolites in the samples [2].
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Data file |
KIMODATAID91_v2.xlsx
Preview file
Preview file KIMODATAID91_v2.xlsx
GraphLoading...
GraphLoading...
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative format(s) |
no file uploaded | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export metadata |
RDF:
metadataDataEntryID91.rdf
XML: metadataDataEntryID91.xml Plain text: metadataDataEntryID91.txt |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cite Data EntryID 91
APA |
KiMoSys (https://kimosys.org). (2020, November 21). Data EntryID 91 (Rattus). https://doi.org/10.34619/vacj-fn92
|
|
MLA |
KiMoSys (https://kimosys.org). "Data EntryID 91 (Rattus)." 2024, https://doi.org/10.34619/vacj-fn92
|
|
ISO-690 |
KiMoSys (https://kimosys.org). Data EntryID 91 (Rattus). [online], [Accessed 21 November 2024]. Available from: https://doi.org/10.34619/vacj-fn92
|
|
BibTeX |
@misc{ KiMoSysDataEntryID91,
author = "{KiMoSys (https://kimosys.org)}",
title = "Data EntryID 91 (Rattus)",
url = https://doi.org/10.34619/vacj-fn92",
doi = "10.34619/vacj-fn92",
note = "[Online; accessed 21-November-2024]"
}
|
Related Data: AccessID 59
Entered by:
Administrator KiMoSysFirst name: Administrator
Affiliation: INESC-ID/IST
Homepage: http://kdbio.inesc-id.pt/kimosys
Interests: mathematical modeling, accessible data, use of data
Created: 2016-03-25 16:53:20 UTC
Team
Liangcai ZhaoFirst name: Liangcai
Affiliation: Wenzhou Medical University
Homepage:
Interests:
Updated: 2020-04-24 16:10:35 UTC
Version: 2
Status: (reviewed) 2016-03-29 12:07:02 UTC
Views: 249
Downloads: 60
Associated Models
Here we can find relevant models associated with Data EntryID 91:
Model EntryID |
Model name | Category | Model Type | Data used for | Access | Json |
---|
Associate models to data
- Several models can be associated.